当您发现国家企业信用信息公示系统与工商信息存在误差时，可以按照以下步骤进行处理：

核对信息准确性

首先，请进入国家企业信用信息公示系统，输入企业名称、统一社会信用代码或注册号进行查询，仔细核对公示信息与您掌握的正确信息是否确实存在误差。

根据信息类型处理

• 年报公示信息错误：如果错误发生在企业年度报告公示信息中，且仍在每年6月30日的截止日期前，您可以重新登录系统进行修改。
• 其他信息错误：对于股东出资信息等“其他信息”的填写错误，您可以随时登录系统进行修改。

联系登记机关

如果信息已过更正期或无法自行修改，您需要联系作出该信息公示决定的登记机关（通常是当地的市场监督管理部门）进行更正。

依据《企业信息公示暂行条例》，公民、法人或其他组织有证据证明政府部门公示的信息不准确的，有权要求该政府部门予以更正。

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准备并提交更正材料

按照登记机关的要求，准备好相关的更正材料，例如信息更正表格、营业执照、法人身份证等证明文件，并提交申请2

。审核通过后，请定期核查信息是否已更新。

了解相关责任

企业有义务确保公示信息的准确性。如果因公示信息不实导致第三方损失，企业可能需要承担民事赔偿责任；如果存在信息造假行为，还可能面临行政处罚，甚至刑事责任。

通过以上步骤，您可以有效地处理国家企业信用信息公示系统与工商信息之间的误差问题。